Комп'ютер навчили розпізнавати поодинокі ракові клітини
Новий алгоритм SCENIC реконструює генну регуляторну мережу і розпізнає стан одиночної клітини
- Головна
-
12 жовтня 2017 21:33
Завдяки цьому алгоритму, лікарі зможуть розпізнавати окремі типи ракових клітин, передає Depo.ua з посиланням на Новое время.
Останні досягнення в області одноклітинного секвенування вже дозволили виміряти, які з наших 20000 генів активні в окремій клітці. Ці методи забезпечують безпрецедентний рівень деталізації. Але, коли цей метод застосовується до тисяч клітин з різних тканин, завдання стає дуже складним, оскільки необхідно обробити величезні обсяги даних.
"Ми розробили SCENIC, комп'ютерну програму, яка ідентифікує різні типи клітин, на основі експресії генів, швидко і точно. Це дозволяє краще зрозуміти, як регулюється доля типів клітин, а також дозволяє ідентифікувати основні регулятори, які можуть бути потенційними цілями ліків", - пояснив біолог Стен Аертс, один з авторів алгоритму.
Після застосування програми виявилося, що кластерний аналіз за типом клітини виявився для SCENIC точнішим, ніж у багатьох спеціалізованих методів кластеризації окремих клітин.
"Цей новий метод не тільки допоможе нам дізнатися більше про різні клітини в нашому тілі. Це також дозволить нам дізнатися про те, як активність клітин змінюється протягом часу, або коли ми хворіємо", - пояснила один з авторів дослідження, Сара Айбар Сантос.
Команда вже застосувала цей метод до тканини мозку мишей і людини. Вони також використовували його для аналізу і порівняння ракових клітин головного мозку і пухлин шкіри, що призвело до виявлення нових типів клітин, пов'язаних з метастазами, а також дозволило краще зрозуміти механізм поширення ракових клітин в інші частини тіла.
Більше новин про події в Україні та світі на Depo.ua
Всі новини на одному каналі в Google News
- 15:48Звалище "зубів дракона" на Сумщині: В ОВА розповіли, що буде далі
- 15:29 Від початку доби рашисти 44 рази штурмували наші позиції, переважно на трьох напрямках
- 15:15Вовчанськ російські терористи стирають з лиця землі, - ЦПД (ФОТО) ФОТО
- 15:03Антикорупціонер Шабунін потрапив у скандал: привласнив автомобіль, який закупили для фронту (ВІДЕО) ФОТО Відео
- 14:40Печерну стоянку людей кам'яного віку на Закарпатті беруть під охорону
- 14:20 У напрямку Часів Яру противник широко застосовує бронетехніку, гаряче й на інших напрямках фронту, - Генштаб
- 13:45 Загибель командира та попадання по базі ппо рф в Криму: Росзмі підтвердили влучання
- 13:27Школа, магазин, газопровід, десятки будинків: Наслідки обстрілів Херсонщини
- 13:0317 травня ворог 2 352 рази обстрілював Донеччину: Є загиблі й поранені
- 12:30 Відключення світла 18 травня плануються лише для промислових споживачів, - Міненерго
- 11:41Дві доби поспіль росіяни "тиснуть" на Кринки, що на Херсонщині
- 11:21У Хмельницькому будівельник зірвався з висоти (ФОТО) ФОТО
- 11:09У Харкові внаслідок удару рф 17 травня загинули 3 людей, 31 дістали поранення, - ОВА
- 10:39На Закарпатті дві жінки оформлювали фіктивне опікунство для військовозобов’язаних
- 10:16З Харківщини вивезли майже 10 тисяч цивільних (ВІДЕО) Відео
- 10:00Як влаштовані слоти і що вони являють собою PROMO
- 09:41На Полтавщині є ураження
- 09:19Обстріл Одещини: одна людина загинула, ще 8 отримали поранення
- 09:00 Закон про мобілізацію набрав чинності: Про що слід пам'ятати