Компьютер научили распознавать одиночные раковые клетки
Новый алгоритм SCENIC реконструирует генную регуляторную сеть и распознает состояние одиночной клетки
- Весь мир
-
12 октября 2017 21:33
Благодаря этому алгоритму, врачи смогут распознавать отдельные типы раковых клеток, передает Depo.ua со ссылкой на Новое время.
Последние достижения в области одноклеточного секвенирования уже позволили измерить, какие из наших 20000 генов активны в отдельной клетке. Эти методы обеспечивают беспрецедентный уровень детализации. Но, когда этот метод применяется к тысячам клеток из различных тканей, задача становится очень сложной, поскольку необходимо обработать огромные объемы данных.
"Мы разработали SCENIC, компьютерную программу, которая идентифицирует различные типы клеток, на основе экспрессии генов, быстро и точно. Это позволяет лучше понять, как регулируется судьба типов клеток, а также позволяет идентифицировать основные регуляторы, которые могут быть потенциальными целями лекарств", - пояснил биолог Стен Аэртс, один из авторов алгоритма.
После применения программы оказалось, что кластерный анализ по типу клетки оказался для SCENIC точнее, чем у многих специализированных методов кластеризации отдельных клеток.
"Этот новый метод не только поможет нам узнать больше о различных клетках в нашем теле. Это также позволит нам узнать о том, как активность клеток меняется в течение времени, или когда мы заболеваем", - объяснила один из авторов исследования, Сара Айбар Сантос.
Команда уже применила этот метод к ткани мозга мышей и человека. Они также использовали его для анализа и сравнения раковых клеток головного мозга и опухолей кожи, что привело к выявлению новых типов клеток, связанных с метастазами, а также позволило лучше понять механизм распространения раковых клеток в другие части тела.
Больше новостей о событиях в Украине и мире на Depo.ua
Все новости на одном канале в Google News
- 17:50"Украинская команда" призывает отблагодарить защитников, приобщившись к Пасхальному сбору на дроны-самолеты
- 23:44Хоккейная сборная Украины выиграла чемпионат мира в своем дивизионе
- 21:34Эксперт: Ударами по НПЗ россии СБУ сажает путина на болезненный шпагат
- 18:03Неделя в эфире. Как будили украинцев в утреннем шоу "Просыпайся!" на "Мы-Украина+"?
- 16:13Киев до сих пор защищает водная линия обороны, которая появилась в начале войны благодаря Александру "Тихоходу", — эксперт
- 15:36Главный матч хоккейного сезона: сегодня сборную Украины ждет финал чемпионата мира
- 10:01 Спецоперация СБУ в Харькове: Враг намеревался поразить противовоздушную оборону ФОТО
- 09:54Оккупанты потеряли еще 20 танков и более тысячи военных, — Генштаб
- 08:37Обстрелы в Харьковской области: Синегубов рассказал о последствиях ударов 2 мая
- 19:41Григорий Козловский и ФК "Рух" устроили праздник для детей погибших защитников ФОТО
- 16:31Виталий Кличко примет участие в Саммите мэров европейских городов в Париже
- 16:28 Оккупанты сбросили КАБ возле Харькова: Пострадали четверо детей
- 14:36 Нардепу от "слуг" вручили подозрение в незаконном обогащении на 11 млн. грн.
- 13:46СМИ обвинили нардепа Заблоцкого в лоббировании поправки к растаможке авто: "В Украину поедет автомобильный хлам"
- 13:06IT-специалист Евгений Шевцов: Департамент киберполиции играет важную роль в борьбе с российскими хакерами PR
- 13:01СБУ схватила организатора "референдума" за присоединение оккупированной части Харьковщины к рф ФОТО
- 12:34 В Харькове дали пожизненное российскому командиру, который расстреливал гражданских ФОТО
- 12:30Ударом по "Новой почте" в Одессе рашисты уничтожили посылок на 3 миллиона грн
- 11:47Транспортный коллапс в Чернигове: И.о. мэра требует от Совета обороны области немедленно восстановить движение транспорта